Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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USP9XQ93008 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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USP9XQ93008 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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USP9XQ93008 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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USP9XQ93008 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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USP9XQ93008 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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