Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms