Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms