Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms