Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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ZNF439Q8NDP4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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