Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms