Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5M4

TTC9C, Tetratricopeptide repeat protein 9C, humanhuman

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9CQ8N5M4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TTC9CQ8N5M4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TTC9CQ8N5M4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TTC9CQ8N5M4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TTC9CQ8N5M4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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