Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms