Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms