Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms