Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms