Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms