Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A4Q6YBV0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms