Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms