Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms