Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms