Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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