Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms