Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI97

C11orf88, UPF0722 protein C11orf88, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf88Q6PI97 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf88Q6PI97 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms