Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6P435 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6P435 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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