Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms