Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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