Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms