Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms