Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX7Q2KHR2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX7Q2KHR2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms