Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms