Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms