Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms