Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA9Q16790 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CA9Q16790 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CA9Q16790 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CA9Q16790 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CA9Q16790 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CA9Q16790 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CA9Q16790 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CA9Q16790 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CA9Q16790 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CA9Q16790 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CA9Q16790 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CA9Q16790 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CA9Q16790 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CA9Q16790 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CA9Q16790 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CA9Q16790 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CA9Q16790 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CA9Q16790 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CA9Q16790 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CA9Q16790 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CA9Q16790 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CA9Q16790 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CA9Q16790 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA9Q16790 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA9Q16790 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CA9Q16790 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA9Q16790 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA9Q16790 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA9Q16790 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA9Q16790 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA9Q16790 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA9Q16790 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CA9Q16790 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CA9Q16790 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA9Q16790 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA9Q16790 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CA9Q16790 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CA9Q16790 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA9Q16790 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA9Q16790 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA9Q16790 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA9Q16790 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CA9Q16790 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA9Q16790 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA9Q16790 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CA9Q16790 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CA9Q16790 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CA9Q16790 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CA9Q16790 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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CA9Q16790 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA9Q16790 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms