Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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