Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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