Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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