Protein–RNA interactions for Protein: Q156A1

ATXN8, Ataxin-8, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8Q156A1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATXN8Q156A1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms