Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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