Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

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Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
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