Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms