Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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