Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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PRKD1Q15139 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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PRKD1Q15139 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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PRKD1Q15139 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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PRKD1Q15139 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKD1Q15139 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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