Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
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