Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ODF1Q14990 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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