Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms