Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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PDE6HQ13956 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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PDE6HQ13956 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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PDE6HQ13956 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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PDE6HQ13956 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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PDE6HQ13956 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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PDE6HQ13956 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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PDE6HQ13956 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
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PDE6HQ13956 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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