Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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