Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms