Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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