Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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