Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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