Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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