Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms