Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms